본교 통일안보대학원은 우리 민족의 최대 숙원인 민족통일을 실현할 수 있는 정책연구와 통일과 북한에 관한 전문적 교육을 하기 위하여 2002년 3월에 개원하여, 석사학위과정 2개 학과(통일안보심리학과, 스마트국방경영학과)를 운영하고 있으며, 통일안보심리학과에 통일학, 군 아동 청소년상담심리학전공, 스마트국방경영학과에는 국방경영학, 군사전략학 전공이 있고, 수업은 야간에 진행된다.